El país pateix una creixent crisi econòmica i humanitària arran del conflicte que hi ha al veí Sudan. Es calcula que cada dia fugen més de 2.000 persones que travessen cap al Sudan del Sud, un país on més de la meitat de la població passa fam i els sistemes estan mal equipats per gestionar l'afluència.
Encara que molts són refugiats sudanesos, aproximadament el 91 % dels nouvinguts són sud-sudanesos retornats, que van deixar el seu país i han hagut de tornar, però que no es poden acollir als programes internacionals per a refugiats, aquest fet augmenta el repte que afronta el país per a donar refugi i serveis a aquestes persones.
El 2022, 9,4 milions de persones van necessitar ajuda humanitària al Sudan del Sud, exactament el 76 % de la població. Més de la meitat del país va patir inseguretat alimentària aguda i es calcula que 1,4 milions d'infants menors de cinc anys patiran desnutrició aguda el 2023. El 59 % de la població de tot el Sudan del Sud no va tenir accés a aigua neta i segura.
Malgrat que les necessitats creixen, el finançament humanitari no para de baixar, cosa que deixa immenses llacunes per cobrir.
